Από ότι όμως φαίνεται το κλείσιμο του MegaUpload για λόγους πειρατείας είχε ως "παρενέργεια" να χαθούν και αρκετά αρχεία που ήταν νόμιμα αποθηκευμένα.
Σύμφωνα με τις πρώτες εκτιμήσεις το πλήθος των αρχείων που ήταν νόμιμα και χάθηκαν άδικα ξεπερνάει τα 10 εκατομμύρια.
Έτσι χιλιάδες χρήστες που είχαν αποθηκεύσει εκεί νόμιμο υλικό ή είχαν κάνει κάποιο backup έχασαν τα αρχεία τους άδικα.
Από ότι φαίνεται λοιπόν το κλείσιμο του MegaUpload τον Ιανουάριο του 2012 ήταν ένα φιάσκο αφού οι υπεύθυνοι δεν έκαναν σωστή έρευνα πριν διαγράψουν τα αρχεία που ήταν αποθηκευμένα στους servers του site.
